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AF-722: Modelagem e análise de dados experimentais com o programa computacional R

AF-722: Modelagem e análise de dados experimentais com o programa computacional R

Detalhes da oferta da disciplina

  • Curso: Aberto para alunos de pós-graduação.
  • Pré-requisito: Estatística Experimental.
  • Período: 2014, 1 trimestre.
  • Local: UFPR, Campus I - Agrárias.
  • Horário: Sexta-feira, 14h00-17h00.
  • Atendimento da monitoria:
    • Vanessa Sehaber: Qua 9h00-12h00, LEG - Centro Politécnico (mapa);
    • Henrique Laureano: Qui 14h00-17h00, LEMID - Agrárias;
  • Cartão de referência: Guia rápido do usuário R - tradução por Conrado Oliveira (ex-aluno).

Referências bibliográficas

Tutoriais curtos

  1. Fundamentos da linguagem;
  2. Estatística básica e análise gráfica;
  3. Modelos de regressão;
  4. Estatística Experimental.

<bibtex>

@TechReport{ribeiro_jr-leg,

url = {http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa/Rembrapa.pdf},
year = {2009},
author = {Paulo Justiniano {Ribeiro Júnior}},
title = {Introdução ao Ambiente Estatístico R}

}

@TechReport{faraway-cran,

url = {http://cran.r-project.org/doc/contrib/Faraway-PRA.pdf},
year = {2002},
author = {Julian J. Faraway},
title = {Practical Regression and Anova using {R}}

}

@book{logan2011biostatistical,

title={Biostatistical Design and Analysis Using R: A Practical Guide},
author={Logan, M.},
isbn={9781444362473},
url={http://books.google.com.br/books?id=ZvOljlNiWGkC},
year={2011},
publisher={Wiley}

}

@book{faraway_linear_2005,

      title = {Linear models with R},
isbn = {9781584884255},
publisher = {Chapman \& Hall/{CRC}},
author = {Julian James Faraway},
year = {2005},
pages = {244}

}

@book{faraway2005extending,

title={Extending the Linear Model with R: Generalized Linear, Mixed Effects and Nonparametric Regression Models},
author={Faraway, J.J.},
isbn={9780203492284},
series={Chapman \& Hall/CRC Texts in Statistical Science},
url={http://books.google.com.br/books?id=ODcRsWpGji4C},
year={2005},
publisher={Taylor \& Francis}

}

@book{schabenberger2001contemporary,

title={Contemporary Statistical Models for the Plant and Soil Sciences},
author={Schabenberger, O. and Pierce, F.J.},
isbn={9781584881117},
lccn={20043254},
url={http://books.google.com.br/books?id=c2Rr\_J7geGQC},
year={2001},
publisher={Taylor \& Francis}

}

@book{dean2013design,

title={Design and Analysis of Experiments},
author={Dean, A.M. and Voss, D.},
isbn={9781475772920},
series={Springer Texts in Statistics},
url={http://books.google.com.br/books?id=GnI\_nwEACAAJ},
year={2013},
publisher={Springer New York}

}

@book{venables_modern_2002,

title = {Modern applied statistics with S},
isbn = {9780387954578},
publisher = {Birkhäuser},
author = {William N. Venables and Brian D. Ripley},
year = {2002},
pages = {518}

}

@book{hay2011r,

title={An R Companion to Linear Statistical Models},
author={Hay-Jahans, C.},
isbn={9781439873656},
lccn={2011039833},
url={http://books.google.com.br/books?id=nNhesIrJ\_PoC},
year={2011},
publisher={Taylor \& Francis}

}

@book{matloff2011art,

title={The Art of R Programming: A Tour of Statistical Software Design},
author={Matloff, N. and Matloff, N.S.},
isbn={9781593274108},
url={http://books.google.com.br/books?id=4jL3sfmP1l8C},
year={2011},
publisher={No Starch Press}

}

@book{everitt_handbook_2009,

edition = {2},
title = {A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition},
isbn = {1420079336},
publisher = {Chapman \& Hall},
author = {Brian S. Everitt and Torsten Hothorn},
month = jul,
year = {2009}

}

@book{dalgaard_introductory_2008,

edition = {2nd},
title = {Introductory Statistics with R},
isbn = {0387790535},
publisher = {Springer},
author = {Peter Dalgaard},
month = aug,
year = {2008}

}

@book{dobson_introduction_2008,

edition = {3},
title = {An Introduction to Generalized Linear Models, Third Edition},
isbn = {1584889500},
publisher = {Chapman and {Hall/CRC}},
author = {Annette J. Dobson and Adrian Barnett},
month = may,
year = {2008}

}

@book{ritz_nonlinear_2008,

edition = {1},
title = {Nonlinear Regression with R},
isbn = {0387096159},
publisher = {Springer},
author = {Christian Ritz and Jens Carl Streibig},
month = nov,
year = {2008}

}

@book{sarkar_lattice:_2008,

edition = {1},
title = {Lattice: Multivariate Data Visualization with R},
isbn = {0387759689},
publisher = {Springer},
author = {Deepayan Sarkar},
month = mar,
year = {2008}

}

@book{murrell_r_2005,

edition = {1},
title = {R Graphics},
isbn = {{158488486X}},
publisher = {Chapman and {Hall/CRC}},
author = {Paul Murrell},
month = jul,
year = {2005}

}

</bibtex>


Download e instalação do R e editores
Cartões de referência para regressão
Regressão e medidas de diagnóstico

Scripts, notas e documentos


Histórico das Aulas do Curso

Abaixo o histórico de atividades realizadas em classe e atividades extra classe aplicadas.

  1. 14/03:
    • Aula inicial, estrutura do curso, referências bibliográficas, horários, etc;
    • Fundamentos do planejamento de experimento: experimentos vs estudos observacionais, repetição vs replicação, métodos de controle local;
    • Modelo estatístico para representar os experimentos planejados, componentes e pressupostos do modelo, formas de estender o modelo;
    • Falácias comuns à estatística experimental.
  2. 21/03:
    • Fatores qualitativos e quantitativos;
    • Fatores de efeito fixo e aleatório;
    • Tipos de arranjos experimentais: fatorial completo/incompleto/fracionado, classificação hierárquica;
    • Modelos estatísticos associados aos experimentos em DIC, DBC e DQL;
    • Tipos de parametrização: zera 1º ou último nível, soma zero, Helmert;
    • Usando o computador para casualizar unidades experimentais;
    • Prática com o R para análise de experimentos em DIC, DBC e DQL.
  3. 28/03:
    • Experimentos com amostragem dentro de parcelas;
    • Modelos lineares de efeitos mistos;
    • Prática com o R para análise de experimento em DQL 11x11 com 4 amostras por parcela;
    • Análise dos resíduos e transformação da resposta (proporção amostral) por meio da família Box-Cox;
  4. 04/04:
    • Regressão linear simples, polinomial e múltipla;
    • Medidas de diagnóstico e avaliação dos pressupostos;
    • Bandas de confiança e predição;
    • Método stepwise para seleção de modelos;
  5. 11/04: (previsto)
    • Regressão combinada com variáveis categóricas;
    • Análise de covariância;
  6. 18/04
  7. 25/04
  8. 02/05
  9. 09/05
  10. 16/05
  11. 23/05
  12. 30/05
  13. 06/06

Avaliações


Passos para disponibilizar arquivos

  1. Subir os arquivos (preferencialmente *.txt para dados) site datafilehost;
  2. Seguir as etapas caixas numeradas da figura abaixo: 1 - escolher o arquivo, 2 - fazer upload, 3 - copiar o link para colar na mensagem e 4 - em caso de erro use o link para deletar o arquivo;
  3. Junto ao link para o arquivo coloque informações sobre o mesmo livro do qual foi retirado, página, número da tabela, nomenclatura das variáveis, contexto, objetivos da análise, unidade de medida das variáveis. As caixas numeradas indicam: 1 - identificação do remetente, 2 - mensagem contendo informações básicas e link para download, 3 - preenchimento de código de segurança e 4 - para concluir com o envio da mensagem.

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