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Interface do R com códigos compilados
Nas instruções a seguir os comandos precedidos de $ devem ser digidados na linha de comando do Linux (ou análogo em outro sistema operacional), e os precedidos por > devem ser digitados no R.
Códigos escritos e compilados em linguagens C, C + + ou Fortran podem ser chamados de dentro do R conforme ilustramos nos exemplos a seguir. Os passos básicos para tal procedimento são:
- Escrever o código na linguagem desejada (
C,C + +ouFortran) - Compilar o código como o comando do linux (no Windows deve-se usar um comando análogo)
$ R CMD SHLIB - Carregar o código compilado no R com o comando
> dyn.load()
- Usar a(s) função(ões) do código compilado com os comandos
.C(),.Call()ou.Fortran().
Exemplo 1
Considere escrever uma função em C para calcular valores da função de correlação de Matèrn. Esta função tem como argumento u e parâmetros
e é dada pela seguinte expressão:
No arquivo clavras01.c encontra-se um código C para calcular valores de uma versão padronizada desta função onde
.
Exemplo 2
Considere agora uma extensão do exemplo anterior onde temos mais de um arquivo de código. Além do arquivo com código C anterior considere também o arquivo clavras02.c onde mais duas rotinas em