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Tabela de conteúdos
GEM² - GRUPO DE ESTUDO EM MODELOS MISTOS
Objetivo
Geral
- Estudar modelos misto em uma abordagem teórica e computacional
Especificos, Abordodagem em:
- Experimentação Agropecuária
- Genética
- Modelagem Ambiental
Participantes:
Scripts
- REML e ML Comparação entre verossimilhança (ML) e verossimilhança residual (REML) em modelos mistos
- Scritps Extending the Linear Model with R
- Random Effects Material Atualizado do livro
Slides, notas de aula e apostilas
- Douglas Bates Tour em Amsterdam(2011), Madson(2011), Gaithersburg(2010), Seewiesen(2009), Rennes(2009), Lausanne(2009);
Histórico
- Em preto: conteúdo abordado no encontro;
- Em verde: conteúdo previsto para o próximo encontro;
Data | Hora | Acontecimento |
---|---|---|
23/03/2011 | 17:30 | Discussão inicial do grupo - Walmes, PJ , Éder, Renato |
20/05/2011 | 16:00 | Discussão sobre separação de atividades (Derivação das expressões, ML, REML, PQL, Inferência em MM, exemplos em genética e experimentação ) |
17/06/2011 | 16:00 | Procedimento REML de estimação de componentes de variância em LMM (PJ). Implementação de funções de verossimilhança para estimação de parâmetros em GLMM sem e com estrutura para um fator de efeito aleatório (WB). |
01/07/2011 | 16:00 | Procedimentos PQL para modelos mistos na família exponencial (SS), métodos numéricos (Gauss-Hermite, Laplace, Quasi Monte Carlo) empregados para estimação em modelos mistos (WB). |
08/07/2011 | 16:00 | Implementação do procedimento REML (EB), PQL (SS) e predição de efeitos aleatórios (PJ). |
—-
Lista de afazeres
- (17/06/2011)
- WB: disponibilizar os scripts apresentadas em 17/06;
- WZ: preparar documento com a distribuição marginal em LMM;
- PJ & WZ: preparar documento com a derivação e implementação (didática) do método REML;
- (01/07/2011)
- WZ: documentar os procedimentos de estimação empregando métodos numéricos para a integração dos efeitos aleatórios escritos por WB, rodar glmm.PQL(), glmer();
- SS: implementar o PQL;
- EB: implementar o REML;
- PJ: procedimentos para predição dos efeitos aleatórios;
Referências
Artigos
Livros
<bibtex>
@book{magalhaes,
title = {Noções de Probabilidade e Estatística}, publisher = {Edusp}, author = {M N Magalhães and A C P Lima}, year = {200?}, edition = {1}, pages = {540}
}
@TechReport{ribeiro_jr-leg,
url = {http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa/Rembrapa.pdf}, year = {2009}, author = {Paulo Justiniano {Ribeiro Júnior}}, title = {Introdução ao Ambiente Estatístico R}
}
@book{venables_modern_2002,
title = {Modern applied statistics with S}, url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Modern%20Applied%20Statistical%20Methods%20with%20S%20plus.pdf}, isbn = {9780387954578}, publisher = {Birkhäuser}, author = {William N. Venables and Brian D. Ripley}, year = {2002}, pages = {518}
}
@book{everitt_handbook_2009,
edition = {2}, title = {A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition}, %url = {http://www.maths.bath.ac.uk/~jjf23/ELM/}, url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/A%20handbook%20of%20statistical%20analyses%20using%20R.pdf}, isbn = {1420079336}, publisher = {Chapman \& Hall}, author = {Brian S. Everitt and Torsten Hothorn}, month = jul, year = {2009}
}
@book{dalgaard_introductory_2008,
edition = {2nd}, title = {Introductory Statistics with R}, url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Introductory%20Statistics%20with%20R.pdf}, isbn = {0387790535}, publisher = {Springer}, author = {Peter Dalgaard}, month = aug, year = {2008}
}
@book{sarkar_lattice:_2008,
edition = {1}, title = {Lattice: Multivariate Data Visualization with R}, url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Lattice%20Multivariate%20Data%20Visualization%20with%20R.pdf}, isbn = {0387759689}, shorttitle = {Lattice}, publisher = {Springer}, author = {Deepayan Sarkar}, month = mar, year = {2008}
} </bibtex>
Software
- The R project for Statistical Computing: página do programa R
- nlme Linear and Nonlinear Mixed Effects Models
- Uma página interessante com um introdução ao R
- O Xemacs é uma outra opção de editor que facilita a edição de arquivos do
e R e disponível para plataformas Linux e Windows.
- R-br é a lista de discussão em português sobre o uso do R