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GEM² - GRUPO DE ESTUDO EM MODELOS MISTOS

GEM² - GRUPO DE ESTUDO EM MODELOS MISTOS

Objetivo

Geral

  1. Estudar modelos misto em uma abordagem teórica e computacional

Especificos, Abordodagem em:

  1. Experimentação Agropecuária
  2. Genética
  3. Modelagem Ambiental

Participantes:

Scripts


Slides, notas de aula e apostilas


Histórico

  • Em preto: conteúdo abordado no encontro;
  • Em verde: conteúdo previsto para o próximo encontro;
Data Hora Acontecimento
23/03/2011 17:30 Discussão inicial do grupo - Walmes, PJ , Éder, Renato
20/05/2011 16:00 Discussão sobre separação de atividades (Derivação das expressões, ML, REML, PQL, Inferência em MM, exemplos em genética e experimentação )
17/06/2011 16:00 Procedimento REML de estimação de componentes de variância em LMM (PJ). Implementação de funções de verossimilhança para estimação de parâmetros em GLMM sem e com estrutura para um fator de efeito aleatório (WB).
01/07/2011 16:00 Procedimentos PQL para modelos mistos na família exponencial (SS), métodos numéricos (Gauss-Hermite, Laplace, Quasi Monte Carlo) empregados para estimação em modelos mistos (WB).
08/07/2011 16:00 Implementação do procedimento REML (EB), PQL (SS) e predição de efeitos aleatórios (PJ).

—-

Lista de afazeres

  • (17/06/2011)
    • WB: disponibilizar os scripts apresentadas em 17/06;
    • WZ: preparar documento com a distribuição marginal em LMM;
    • PJ & WZ: preparar documento com a derivação e implementação (didática) do método REML;
  • (01/07/2011)
    • WZ: documentar os procedimentos de estimação empregando métodos numéricos para a integração dos efeitos aleatórios escritos por WB, rodar glmm.PQL(), glmer();
    • SS: implementar o PQL;
    • EB: implementar o REML;
    • PJ: procedimentos para predição dos efeitos aleatórios;

Referências

Artigos

Livros

<bibtex>

@book{magalhaes,

title = {Noções de Probabilidade e Estatística},
publisher = {Edusp},
author = {M N Magalhães and A C P Lima},
year = {200?},
      edition = {1},
pages = {540}

}

@TechReport{ribeiro_jr-leg,

url = {http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa/Rembrapa.pdf},
year = {2009},
author = {Paulo Justiniano {Ribeiro Júnior}},
title = {Introdução ao Ambiente Estatístico R}

}

@book{venables_modern_2002,

title = {Modern applied statistics with S},
      url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Modern%20Applied%20Statistical%20Methods%20with%20S%20plus.pdf},
isbn = {9780387954578},
publisher = {Birkhäuser},
author = {William N. Venables and Brian D. Ripley},
year = {2002},
pages = {518}

}

@book{everitt_handbook_2009,

edition = {2},
title = {A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition},
      %url = {http://www.maths.bath.ac.uk/~jjf23/ELM/},
      url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/A%20handbook%20of%20statistical%20analyses%20using%20R.pdf},
isbn = {1420079336},
publisher = {Chapman \& Hall},
author = {Brian S. Everitt and Torsten Hothorn},
month = jul,
year = {2009}

}

@book{dalgaard_introductory_2008,

edition = {2nd},
title = {Introductory Statistics with R},
      url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Introductory%20Statistics%20with%20R.pdf},
isbn = {0387790535},
publisher = {Springer},
author = {Peter Dalgaard},
month = aug,
year = {2008}

}

@book{sarkar_lattice:_2008,

edition = {1},
title = {Lattice: Multivariate Data Visualization with R},
      url = {http://www.leg.ufpr.br/~walmes/docs/Lattice%20Multivariate%20Data%20Visualization%20with%20R.pdf},
isbn = {0387759689},
shorttitle = {Lattice},
publisher = {Springer},
author = {Deepayan Sarkar},
month = mar,
year = {2008}

} </bibtex>


Software

    1. nlme Linear and Nonlinear Mixed Effects Models
  1. Uma página interessante com um introdução ao R
  2. O Xemacs é uma outra opção de editor que facilita a edição de arquivos do Graph e R e disponível para plataformas Linux e Windows.
  3. R-br é a lista de discussão em português sobre o uso do R


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